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Offener Leserahmen
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top
Als offener Leserahmen (OLR) oder offenes Leseraster (als Γbersetzung von engl. open reading frame, ORF) wird in der Genetik derjenige Bereich der DNA bzw. RNA (Virus-RNA oder mRNA) bezeichnet, dessen Leserahmen zwischen einem Startcodon und dem ersten Stopcodon im gleichen Leseraster liegt. Der offene Leserahmen codiert potenziell die AminosΓ€uresequenz eines Peptids (kurze Sequenz) oder Proteins (lange Sequenz). Eine alternative Definition besagt, dass ein ORF bei Stopcodons beginnt und endet.cite-ref-1[1]cite-ref-2[2]
Offene Leserahmen werden von nicht-codierenden Bereichen des Gens umgeben, dem 5β²-UTR-Bereich und dem 3β²-UTR-Bereich (UTR fΓΌr untranslated region). Dabei handelt es sich um Regionen eines Gens, die zwar bei der Transkription in mRNA transkribiert werden, bei der Translation jedoch nicht fΓΌr eine AminosΓ€uresequenz codieren. In diesen Bereichen liegen auch wichtige Informationen fΓΌr die Translation des offenen Leserahmens.
Bakterielle mRNAs tragen hΓ€ufig mehrere ORFs in einer transkriptionalen Einheit. In diesem Fall spricht man von einem Operon, und die mRNA wird als polycistronisch bezeichnet.
In eukaryotischen Genen wird der ORF oft unterbrochen von Introns, die wΓ€hrend der Prozessierung der mRNA beim SpleiΓen herausgeschnitten werden. Durch alternatives SpleiΓen wird eine Vielzahl von Proteinvarianten mΓΆglich.
Contents
β’ ORFeom
β’ ORFans
β’ Literatur
β’ Einzelnachweise
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ORFeom
ORFans
ORFans sind ORFs ohne nachweisbare Homologe in anderen Linien (siehe Orphan-Gen). Der Ausdruck spielt auf das englische Wort orphan fΓΌr Waise an.
Literatur
β’ Rolf Knippers: Molekulare Genetik. 8. neubearbeitete Auflage. Georg Thieme Verlag, Stuttgart u. a. 2001, ISBN 3-13-477008-3.
Einzelnachweise
cite-note-11. β J.-M. Claverie: Computational methods for the identification of genes in vertebrate genomic sequences. In: Hum. Mol. Genet, Band 6, 1997, S. 1735β1744.
cite-note-22. β P. Sieber, M. Platzer, S. Schuster: The definition of open reading frame revisited. In: Trends Genet, Band 34, 2018, S. 167β170.
cite-note-pmid20701780-33. β S. V. Rajagopala, N. Yamamoto, A. E. Zweifel, T. Nakamichi, H. K. Huang, J. D. Mendez-Rios, J. Franca-Koh, M. P. Boorgula, K. Fujita, K. Suzuki, J. C. Hu, B. L. Wanner, H. Mori, P. Uetz: The Escherichia coli K-12 ORFeome: a resource for comparative molecular microbiology. In: BMC genomics. Band 11, August 2010, S. 470, doi:10.1186/1471-2164-11-470, PMID 20701780, PMC 3091666 (freier Volltext).